Yazar "Kahveci, Yasemin" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    THE EFFECT OF THYMOQUINONE ON THE miRNA PROFILE OF MCF-7 BREAST CANCER CELLS
    (INT JOURNAL PHARMACEUTICAL SCIENCES & RESEARCH, 2017) Saracligil, Beyza; Ozturk, Bahadir; Bozkurt, S. Buket; Kahveci, Yasemin
    Background and aim: Thymoquinone (TQ), which is the most bioactive component of Nigella sativa (Black cumin), exhibits anticancer characteristics based on cell culture and experimental animal studies. However, molecular action mechanisms of these effects are not clear. MicroRNAs (miRNAs), small non-coding RNAs of approximately 22 nucleotides, are an emerging class of gene expression modulators with relevant roles in several biological processes, including cell differentiation, development, apoptosis, and regulation of the cell cycle. The purpose of this study was to investigate the potential impact of thymoquinone (TQ) on MCF-7 human breast cancer cell miRNAs. Materials and methods: The expression levels of miRNAs in MCF-7 cell and TQ treated MCF-7 cells were estimated by miRNA sequencing. The expressions of miRNAs were determined real-time qPCR. Results: We detected 10 down-regulated mirRNAs (hsa-miR-1, let 7c-5p, hsa-miR-15b-5p, hsa-mir-202-3p, hsa-miR-214-3p, hsa-miR-210-3p, hsa-miR-31-5p, hsa-miR-424-5p, hsa-miR-497-5p, hsa-miR-98-5p) and 2 up regulated miRNAs (hsa-miR-22-3p, hsa-miR-132-3p) in TQ treated groups, comparing with control group. These findings highlight the effects of TQ miRNA profile and molecular mechanism on MCF-7 cells. Conclusion: Finally, according to computational analyses using validated databases PI3 kinase/AKT (hsa04151), Wnt (hsa04310), MAPK (hsa04010) and p53 (hsa 04115) signaling pathways seem to be the key targets of these TQ groups of miRNA.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Timokinonun meme kanseri hücrelerinin mirna düzeylerine etkisi
    (Selçuk Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2015) Kahveci, Yasemin; Öztürk, Bahadır
    Nigella Sativa (Çörek otu)'nın en önemli biyoaktif bileşeni olan timokinon (C10H10O2; 2–izopropil-5-metil-1,4–benzokinon), hücre kültürü ve deneysel hayvan çalışmaları temelli antikanser özellikleri sergiler. Ancak, bu etkilerinin moleküler etki mekanizmaları net değildir. Bu çalışma, MCF7 insan meme kanseri hücresi miRNA'ları profilleri üzerine TQ uygulamasının etkilerini incelemektedir Çalışmamızda, MCF-7 hücreleri timokinonun farklı dozları (5,25,50 uM) ile 70. saatte muamele edildi. Daha sonra total RNA, Roche yüksek saf miRNA İzolasyon Kiti (Roche Diagnostics) kullanarak izole edildi ve hücre lizatlarından cDNA sentezlendi. Gerçek zamanlı qPCR için 84 adet miRNA ekspresyonu, BioMarkTM 96,96 Dynamic Array (Fluidigm Corporation) ile saptanmıştır. İstatistiksel analiz Biogazelle en qase Plus 2,0 yazılımı kullanılarak yapıldı. Göreceli gen ekspresyonu değerlerinin tayini 2-ΔΔCt yöntemi (numunenin normalize edilmiş Ct (eşik döngüsü ) değeri- kontrolün normalize edilmiş Ct değeri) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. İstatistiksel analizler sonucunda, kontrol grubuna kıyasla 84 miRNA'nın 12 tanesi farklı şekilde (fold regulation <2, fold regulation>2, p<0.05) eksprese edilmiştir. Kontrol grubuna kıyasla TQ uygulanan gruptaki miRNA'lardan 10 tanesi downregule (hsa-miR-1, let 7c-5p, hsa-miR-15b-5p, hsa-mir-202-3p, hsa-miR-214-3p, hsa-miR-210-3p, hsa-miR-31-5p, hsa-miR-424-5p, hsa-miR-497-5p, hsa-miR-98-5p) ve 2 tanesinin upregule (hsa-miR-22-3p, hsa-miR-132-3p) olduğu saptanmıştır. Özelleştirilmiş veri tabanları kullanarak hesaplanan analizlere göre (DIANA miRPath v.2.0), PI3 kinaz/AKT (hsa04151), Wnt (hsa04310), MAPK (hsa04010) ve p53 (hsa 04115) sinyal yollakları (KEGG yolak numarası) bu miRNA grubunun temel hedefleri olduğu gibi görünmektedir. Bu bulgular, MCF-7 hücrelerinin miRNA profillerine TQ'nun etkilerini vurgulamaktadır ve daha ileri çalışmalara yardımcı olabilir.