Yazar "Karaman, Altuğ" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Comparing Cellulotic Enzyme Activities of Neocallimastix sp. in Orpin’s and Menke’s Media
    (Selçuk Üniversitesi, 2022) Karaman, Altuğ; Yücel, Halit; Ekinci, Kübra; Cömertpay, Sabahattin
    Neocallimastix sp. is a member of the Anaerobic Gut Fungi (AGF) family with unique lignocellulotic enzymes, and it is usually grown in two basic media in vitro. Orpin’s mediais preferred for the detection of enzymatic activites while Menke’s is mostly chosen for evaluating the gases produced during the fermantation. Although these two media were shown to be effective for their targeted purposes, no attempt has been made to compare the activities of various cellulotic enzymes in them. In this study, we measured the growth rate of Neocallimastix sp. in these two media up to 7 days and A similar progress was observed in both (p>0.05). We also discovered that Menke’s media was better for the 5th (p<0.001) and 7th (p<0.0.1) days of Avicellase and for up to 5 days [0 (p<0.001), 3 (p<0.01), 5 (p<0.0001)] of Xylanase activity. Orpin’s media, on the other hand, displayed superior CMCase activity in all time points[0 (p<0.001), 3 (p<0.0001), 5 (p<0.05, 7 (p<0.001)]. As for Cellulase, the activities were measured virtually the same for the both media on the 0th and the 3rd days whereas they were higher in Menke’s (p<0.0001) on the 5th, and in Orpin’s on the 7th day (p<0.01). As a result, in Xylanase enzyme studies, it has been determined that menke media gives better results.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Doğal Streptococcus thermophilus İzolatlarında comX Gen Varlığına Bağlı DNA Transfer Frekansının Belirlenmesi
    (Selçuk Üniversitesi Fen Fakültesi, 2018) Karaman, Altuğ; Yazdıç, Ferit Can; Akyol, İsmail; Eki̇nci̇, Mehmet Sait; Özköse, Emin
    Alternatif sigma faktör olan comX, streptokoklarda dışarıdan DNA alabilme kapasitesini belirleyen genlerin transkripsiyonunu kontrol eden ve dolaysıyla bu suşların yabancı genetik materyali kabul etme frekansı ile ilişkili olan bir gendir. Bu nedenle doğal izolatlardaki varlığının tespit edilmesi, bu izolatların konjugasyon kapasitelerinin belirlenmesi açısından önem arz etmektedir. Bu çalışmada 106 farklı Streptococcus thermophilus izolatında comX geninin varlığı araştırılmıştır. Bu izolatların 46 tanesinde polimeraz zincir tepkimesi (PZT) yöntemi ile comX gen varlığı tespit edilmiş ve nükleotid dizileri belirlenmiştir. Kompetent hücrelerin konjugasyon frekansları için pNZ276 plazmiti ve katalaz testi kullanılmıştır. BioSt-7, 16, 19, 23, 24, 25, 29, 30, 36, 37, 42 ve 46 nolu izolatların konjugasyon özellikleri tespit edilmiştir. BioSt-19, 24, 25,29 ve 42 nolu izolatların da konjugasyon frekansları % 40’tan yüksek bulunmuş ve konjugasyon oranı ile comX gen dizisi arasında ilişki tespit edilmiştir. ComX proteininde 72. amino asit pozisyonundaki asparajinin yerine izolösin değişimi (N?I), konjugasyon frekansını artırmıştır. Bu çalışmanın sonuçları, comX gen dizisi üzerindeki değişim mutasyonlarının izolatların gen transfer sıklığını önemli derecede etkileyebileceğini, suşlara göre farklılık içereceğini ve konjugasyon özelliğini değiştirebileceğini göstermiştir.