Yazar "Keyik, Şerafettin" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 3 / 3
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi(Selçuk Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, 2013-07-31) Keyik, Şerafettin; Arslan, UğurAcinetobacter baumannii sağlık kuruluşlarında hastane enfeksiyonlarına yol açan fırsatçı ve çoklu ilaç direncine sahip önemli bir patojendir. Son on yıldır, D sınıfı beta-laktamazların yayılması nedeniyle A. baumannii?de karbapenemlere dirençte önemli ve tehdit eden bir artış tüm dünyada bildirilmektedir. Bu çalışmanın amacı karbapenemlere dirençli A. baumannii suşlarında OXA tipi ß-laktamazların (OXA-23 ve OXA-58) varlığının ve klonal ilişkilerinin araştırılmasıdır. Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi ve Meram Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Laboratuvarlarında 2007-2012 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden izole edilen toplam 204 A. baumannii suşu çalışmaya alındı. Bakteri identifikasyonu konvansiyonel yöntemler ve Phoenix 100 BD (Becton Dickinson, Sparks) ve VITEK 2 (bioMerieux, France) otomatize sistemleri ile yapıldı. Karbapenem duyarlılık testi Clinical and Laboratory Standards Institute önerilerine göre Kirby-Bauer disk-difüzyon yöntemi ile saptandı. OXA 23-like, OXA-58-like ve OXA-51-like genleri multipleks PCR yöntemi ile araştırıldı ve klonal ilişki pulsed field gel electrophoresis (PFGE) yöntemi ile belirlendi. A. baumannii izoltlarının 105?i imipenem ve meropeneme dirençli idi. Karbapenemlere dirençli A. baumannii izolatlarının hepsi intrensek OXA-51-like geni taşıyordu. blaOXA-23 ve blaOXA-58 genleri sırasıyla izolatların %46.6 ve %53.3?ünde saptandı. blaOXA-23 geni hem Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi hem de Meram Tıp Fakültesi?nde izole edilen suşlarda saptanırken blaOXA-58 geni sadece Meram Tıp Fakültesi suşlarında tespit edildi. A. baumannii izolatlarının ApaI ile kesilen genomik DNA?sına yapılan PFGE yöntemi ile OXA-23 üreten A. baumannii suşlarında 32 farklı grup ve OXA-58 üreten A. baumannii suşlarında 23 farklı grup belirlendi. İki hastane arasında ortak bir salgın izolatı saptanmadı. Bu çalışmada A. baumannii izolatlarında görülen karbapenem direncinde OXA-51 ile birlikte OXA-23 ve blaOXA-58 genlerinin önemli bir rol oynadığı görülmüştür. Karbapenemlere dirençli OXA-23 ve OXA-58 üreten A. baumannii hastane suşlarının epidemik bir potansiyele sahip olduğu ve izolatların epidemiyolojik ilişkisini tanımlamak için moleküler yöntemlerin gerekliliği gösterilmiştir.Öğe Karbapenemlere dirençli acinetobacter baumannii suşlarında OXA tipi beta-laktamazların araştırılması ve PFGE ile genotiplendirilmesi(2014) Keyik, Şerafettin; Arslan, Uğur; Türk, Hatice Dağı; Seyhan, Tuba; Fındık, DuyguAcinetobacter baumannii hastane enfeksiyonlarına yol açan, çoklu ilaç direncine sahip fırsatçı ve önemli bir patojendir. Son 10 yıldır, D sınıfı beta-laktamazların yayılması nedeniyle A.baumannii’de karbapenemlere dirençte önemli ve tehdit eden bir artış tüm dünyadan bildirilmektedir. A.baumannii’de karbapenem direncine neden olan en yaygın beta-laktamaz tipleri OXA-23, OXA-24, OXA-40, OXA- 58 ve OXA-143 serin beta-laktamazlardır. Bu çalışmanın amacı, karbapenemlere dirençli A.baumannii suşlarında OXA tipi beta-laktamazların varlığının ve klonal ilişkilerinin araştırılmasıdır. Çalışmaya, Selçuk Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi (2007-2008) ve Selçuklu (2009-2012) Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Laboratuvarlarında çeşitli klinik örneklerden (68 kan, 18 bronkoalveoler lavaj, 13 drenaj, 3 idrar, 2 beyin omurilik sıvısı, 1 kateter kültürü) izole edilen karbapenemlere dirençli 105 A.baumannii izolatı alınmıştır. Bakterilerin tanımlanması konvansiyonel yöntemler, Phoenix 100 BD (BD Diagnostic, ABD) ve Vitek II (bioMerieux, Fransa) otomatize sistemleriyle yapılmıştır. Karbapenem duyarlılık testi CLSI önerilerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle saptanmıştır. blaOXA 23-like, blaOXA 24-like, blaOXA 51-like ve blaOXA 58-like genleri multipleks polimeraz zincir reaksiyonuyla araştırılmıştır. blaOXA 23-like ve blaOXA 58-like geni taşıyan A.baumannii izolatlarının klonal ilişkisi ApaI enzimi kullanılarak değişken alanlı jel elektroforez (PFGE) yöntemiyle belirlenmiştir. Karbapenemlere dirençli A.baumannii izolatlarının hepsinde blaOXA 51-like geni tespit edilmiş; blaOXA 23-like ve blaOXA 58-like genleri izolatların sırasıyla %46.6 ve %53.3’ünde saptanırken, blaOXA 24-like hiçbir suşta saptanmamıştır. blaOXA 23-like geni hem Meram Tıp Fakültesi Hastanesinde hem de Selçuklu Tıp Fakültesi Hastanesinde izole edilen suşlarda, blaOXA 58-like geni sadece Meram Tıp Fakültesi Hastanesinde izole edilen suşlarda tespit edilmiştir. PFGE yöntemi ile blaOXA 23-like üreten A.baumannii suşlarında 32 farklı grup ve blaOXA 58-like üreten A.baumannii suşlarında 23 farklı grup belirlenmiştir. 58 like İki hastane arasında ortak bir salgın izolatı saptanmamış; ancak bazı klonların Meram Tıp Fakültesi Hastanesinde küçük salgınlar oluşturduğu görülmüştür. Bu çalışmada, A.baumannii izolatlarında görülen karbapenem direncinde, blaOXA 51-like ile birlikte blaOXA 23-like ve blaOXA 58-like genlerinin önemli rol oynadığı belirlenmiştir. Karbapenemlere dirençli blaOXA 23-like ve blaOXA 58-like üreten A.baumannii hastane suşlarının epidemik bir potansiyele sahip olduğu ve izolatların epidemiyolojik ilişkisini tanımlamak için moleküler yöntemlerin kullanılması gerektiği düşünülmüştür.Öğe Karbapenemlere dirençli Acınetobacter baumannıı suşlarında metallo-beta-laktamaz varlığının araştırılması(2012) Türk, Hatice Dağı; Kuş, Halit; Keyik, Şerafettin; Arslan, Uğur; Tuncer, İnci; Fındık, DuyguAcinetobacter türleri antibiyotiklere karşı çoğul direnç geliştirmeleri nedeniyle önemli hastane infeksiyonu etkenleridir. Acinetobacter kökenlerinde beta-laktam antibiyotiklere karşı olan direnç büyük oranda beta-laktamaz üretimine bağlıdır. Metallo-beta-laktamaz (MBL) aktivitesi gösteren IMP ve VIM enzimleri aztreonam dışındaki tüm beta-laktam antibiyotikleri hidroliz edebilme yeteneğindedir. Bu çalışmanın amacı, karbapenemlere dirençli A.baumannii suşlarında MBL enzimlerinin varlığının araştırılmasıdır. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen karbapenemlere dirençli A.baumannii suşları çalışmaya alınmıştır. Bakteri identifikasyonu konvansiyonel yöntemler, Phoenix 100 BD (Becton Dickinson, Sparks) ve VITEK 2 (bioMerieux, Fransa) otomatize sistemleri kullanılarak yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılık testi Clinical Laboratory Standards Institute önerileri dikkate alınarak Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile çalışılmıştır. MBL varlığını araştırmak için kombine disk yöntemi (KDY) uygulanmıştır. KDY ile MBL ürettiği saptanan suşlarda blaIMP ve blaVIM genlerinin varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile araştırılmıştır. Karbapenem dirençli 202 A.baumannii suşunun 139’unda (% 69) KDY ile MBL üretimi saptanmıştır. PCR ile 139 suşun hiçbirinde blaIMP ve blaVIM genleri tespit edilmemiştir. Bu sonuçlar hastanemizdeki A.baumannii suşlarında karbapenem direncinden sorumlu enzimlerin IMP ve VIM olmadığını göstermiştir. MBL üreten bakterilerin aztreonam dışında tüm beta-laktamlara dirençli olması ve tedavide kullanılabilecek bir MBL inhibitörünün bulunmaması epidemiyolojik açıdan MBL varlığının tespit edilmesini önemli kılmaktadır. Bundan sonraki amacımız diğer MBL enzimlerinin varlığını araştırmak olacaktır.
