Y-Chromosome Polymorphisms in 12 Native, Karagül, Karacabey Merino Breeds from Turkey and Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica)

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorParmaksız, Arif
dc.contributor.authorOymak, Ahmet
dc.contributor.authorYüncü, Eren
dc.contributor.authorDemirci, Sevgin
dc.contributor.authorBaştanlar, Evren Koban
dc.contributor.authorÜnal, Emel Özkan
dc.contributor.authorTogan, İnci
dc.date.accessioned2020-03-26T19:45:30Z
dc.date.available2020-03-26T19:45:30Z
dc.date.issued2018
dc.departmentSelçuk Üniversitesien_US
dc.description.abstractIn this study, 182 male animals from 12 native sheep breeds, as well as Karacabey Merino and Karagül breeds of Anatolia, wild sheep AnatolianMouflon (Ovis gmelinii anatolica) were used as the study material. Based on SRY and SRYM18 regions on the Y-chromosome, haplotypes of thepopulations were analyzed using DNA sequence analyses. The SRY region, A-oY1 allele was observed in all of the individuals studied. On the other hand,four different alleles corresponding to four Y-chromosome haplotypes were detected at the SRYM18 microsatellite region. Among native Anatolianbreeds (n143), H6 haplotype (80.41%), H4 haplotype (9.09%), H8 haplotype (8.40%) and H12 haplotype (2.1%) were identified. H6 haplotype wasobserved in all 16 individuals of Ovis gmelinii anatolica. Pairwise FST values based on haplotype frequencies were calculated for domestic sheep, andthe highest FST value was observed between Karagül and Kıvırcık along with Karagül and Ovis gmelinii anatolica with pairwise FST value of 0.43202(P0.01). Y chromosome polymorphism of sheep from Turkey were examined comparatively with the accumulated data in the literature. Out of sevenhaplotypes (H4, H5, H6, H7, H8, H12, H19) observed in Europe and Asia, 4 haplotypes (H4, H6, H8 and H12) were observed in Anatolia. H12 was aprivate haplotype of Sakız, H6 seems to be the predominant haplotype of domestic sheep (79.51%) as well as being the only haplotype observed inOvis gmelini anatolica. H4 haplotype seemed to be associated with fat tailed sheep migrating to Turkey, entering from south east of Turkey, which maybe related with the arrival of nomadic Turks.en_US
dc.description.abstractBu çalışmada, Anadolu’dan yerli evcil koyun (Ovis aries) ırklarından 13 ırk ile kökeni Avrupa’dan olan Bandırma Merinosu koyun ırkı ve Anadolu YabanKoyunu (Ovis gmelinii anatolica)’na ait olmak üzere toplam 182 erkek birey materyal olarak kullanılmıştır. Y kromozomunda bulunan SRY 5’promotorbölgesi ve Y kromozomuna özel bir mikrosatellit olan SRYM18 bölgeleri DNA dizi analizi yöntemleriyle incelenmiştir. SRY bölgesine ait analizlerde tümbireylerde SNP A-oY1 alleline rastlanmıştır. SRYM18 mikrosatellit bölgesinde ise 4 farklı allel görülmüş ve toplamda 4 farklı babasal soy, haplotip, tespitedilmiştir. Yerli Anadolu ırklarında (n143), H6 haplotipi (%80.41), H4 haplotipi (%9.09), H8 haplotipi (%8.40) ve H12 haplotipi (%2.1) belirlenmiştir.Ovis gmelinii anatolica’nın 16 bireyinde de sadece H6 haplotipi gözlenmiştir. Evcil koyunlar için haplotip frekanslarına dayalı FST değerleri hesaplanmışve en yüksek FST değeri Karagül-Kıvırcık ve Karagül-Ovis gmelinii anatolica arasında FST değeri 0.43202 (P0.01) gözlenmiştir. Türkiye koyunlarının Ykromozomu polimorfizmi literatürdeki birikmiş verilerle karşılaştırmalı olarak incelenmiştir. Avrupa ve Asya’da gözlenen yedi haplotipten (H4, H5,H6, H7, H8, H12, H19) dördü Anadolu’da (H4, H6, H8 ve H12) gözlenmiştir. H12, Sakız’ın özel bir haplotipi, H6 ise evcil koyunların baskın haplotipi(%79.51) ve Ovis gmelini anatolica’ nın tek haplotipi olarak görülmektedir. H4 haplotipinin Türkiye’ye güneydoğudan girmiş olabileceği düşünülenyağlı kuyruklu koyunla ilişkili olduğu görülmüştür ve bu koyunların göçebe Türklerin gelişi ile ilişkili olabileceği düşünülmektedir.en_US
dc.identifier.citationParmaksız A., Oymak A., Yüncü E., Demirci S., Baştanlar E. K., Ünal E. Ö., Togan İ. (2018). Y-Chromosome Polymorphisms in 12 Native, Karagül, Karacabey Merino Breeds from Turkey and Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica). Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 24(6), 821-828.
dc.identifier.doi10.9775/kvfd.2018.19962en_US
dc.identifier.endpage828en_US
dc.identifier.issn1300-6045en_US
dc.identifier.issn1309-2251en_US
dc.identifier.issue6en_US
dc.identifier.startpage821en_US
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.9775/kvfd.2018.19962
dc.identifier.urihttp://www.trdizin.gov.tr/publication/paper/detail/TWpnNE1UVTNOdz09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12395/36052
dc.identifier.volume24en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isoenen_US
dc.relation.ispartofKafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.selcuk20240510_oaigen_US
dc.subjectVeterinerliken_US
dc.subjectZiraat Mühendisliğien_US
dc.titleY-Chromosome Polymorphisms in 12 Native, Karagül, Karacabey Merino Breeds from Turkey and Anatolian Mouflon (Ovis gmelinii anatolica)en_US
dc.title.alternativeTürkiye’den 12 Yerli, Karagül, Karacabey Merinosu ve Anadolu Yaban Koyununda (Ovis gmelinii anatolica) Y-Kromozom Polimorfizmlerien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
10343.pdf
Boyut:
872.91 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale Dosyası
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Biyoloji/Makale Koleksiyonu