Edirne ili Söğütlük Ormanı toprağından izole edilen Aspergillus türlerinin biyoçeşitliliği
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2018
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Selçuk Üniversitesi, Mantarcılık Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Çalışmamızda, Edirne ili orman topraklarından izole edilen Aspergillus türlerinin morfolojik-koloniyal ve moleküler yöntemlerle teşhis edilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, Edirne Söğütlük Ormanından, 2016 yılı Mart ayında Brown’un metodu kullanılarak toprak örnekleri alınmıştır. Topraktan fungus izolasyonu için “Toprağı Sulandırma Metodu” kullanılmıştır. Morfolojik çalışmalar için CZ, CYA, CY20S, MEA besiyerlerine yapılan ekimlerden sonra, mikroskobik ve makroskobik karakterler incelenmiştir. Moleküler çalışmalar için ise sırasıyla DNA izolasyonu, calmodulin gen bölgesini hedefleyen PCR işlemleri, PCR ürününün saflaştırılması, dizi analizi ve filogenetik analiz aşamaları uygulanmıştır. Çalışmalar sonucunda 7 adet Aspergillus türü tespit edilmiştir. Bu türler, Aspergillus affinis (Türkiye için yeni kayıt), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (Türkiye için yeni kayıt), Aspergillus spelaeus (Türkiye için yeni kayıt) ve Aspergillus fischeri’dir.
We aimed to isolation and identification of Aspergillus species in Edirne Sogutluk Forest soil by morphological-colonial and molecular methods in our study. For this purpose, soil samples were taken by using Brown's Method in March, 2016 from mentioned forest soil. “Soil Dilution Method” was used for fungus isolation from soil. For the morphological studies, microscopic and macroscopic characters were examined after the operation of inoculating in CZ, CYA, CY20S, MEA media. For the molecular studies, DNA isolation, PCR operations that targeting Calmodulin gene region, purification of the PCR product, sequence analysis and phylogenetics analysis processes were performed respectively. Seven Aspergillus species were detected as a result of studies. These species are Aspergillus affinis (New record for Turkey), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (New record for Turkey), Aspergillus spelaeus (New record for Turkey) and Aspergillus fischeri.
We aimed to isolation and identification of Aspergillus species in Edirne Sogutluk Forest soil by morphological-colonial and molecular methods in our study. For this purpose, soil samples were taken by using Brown's Method in March, 2016 from mentioned forest soil. “Soil Dilution Method” was used for fungus isolation from soil. For the morphological studies, microscopic and macroscopic characters were examined after the operation of inoculating in CZ, CYA, CY20S, MEA media. For the molecular studies, DNA isolation, PCR operations that targeting Calmodulin gene region, purification of the PCR product, sequence analysis and phylogenetics analysis processes were performed respectively. Seven Aspergillus species were detected as a result of studies. These species are Aspergillus affinis (New record for Turkey), Aspergillus awamori, Aspergillus carbonarius, Aspergillus dimorphicus, Aspergillus europaeus (New record for Turkey), Aspergillus spelaeus (New record for Turkey) and Aspergillus fischeri.
Açıklama
DOI:10.30708/mantar.424172
Anahtar Kelimeler
Toprak, Aspergillus, Calmodulin geni, Söğütlük Ormanı, Edirne, Soil, Calmodulin gene, Sogutluk Forest
Kaynak
Mantar Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
9
Sayı
Künye
Ayan, E. G., Asan, A., Şen, B., Ökten, S. (2018). Edirne ili Söğütlük Ormanı toprağından izole edilen Aspergillus türlerinin biyoçeşitliliği. Mantar Dergisi, 9, (2), 126-141.
