Lupınus Albus L. Subsp. Albus Taksonunda Genomik Ssr Markörlerinin Geliştirilmesi
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2023
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Selçuk Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Türkiye’de yetişen Lupinus albus L. subsp. albus (termiye) taksonu spesifik yüksek sayıda
genomik SSR markörünün geliştirilmesi ve bu markörlerin genetik çeşitlilik çalışmalarında kullanılması
hedeflenmiştir. Bu çalışmada 6 farklı popülasyondan toplanan 48 bitki örneği kullanılmıştır. GMAT
programı kullanılarak termiye genomunda sırasıyla 71722, 11657, 1502, 21888 ve 371 adet di-, tri-, tetra-
, penta- ve hekza-nükleotit SSR motifi belirlenmiştir. Bu SSR motiflerinden toplam 107140 adet primer
tasarlanmış ve bu primerlerden 10 adedi PCR çalışmalarında kullanılmıştır. Lupinus albus subsp. albus
taksonuna ait toplanan örnekler CTAB metodu kullanılarak yapraklardan DNA izolasyonu
gerçekleştirilmiştir. İzole edilen genomik DNA’lar SSR markörleriyle PCR reaksiyonuna sokulduktan
sonra PCR fragmentleri % 3’lük agaroz jel elektroforezinde ayrılmıştır. Yapılan çalışmalar sonucunda
populasyonlar arasında polimorfizm bulunamamıştır ve elde edilen bu markörler, bu taksona özgü ilk
SSR markörleridir. Bu markörler Lupinus albus subsp. albus taksonunda genetik çeşitliliğin
değerlendirilmesi, haritalanması ve markör destekli seleksiyon için kullanılabilir.
It is targeted to develop a high number of genomic SSR markers specific for Lupinus albus L. subsp. albus (termiye) taxon grown in Turkey and to use these markers in genetic diversity studies. In this study, 48 plant samples collected from 6 different populations were used. The 71722, 11657, 1502, 21888 and 371 piece di-, tri-, tetra-, penta- and hekza-nükleotit SSR motifs were determined, respectively, in the thermite genome using the GMAT program. A total of 107140 primers were designed from these SSR motifs and 10 of these primers were used in PCR studies. DNA isolation from leaves was performed using the CTAB method from the collected samples of Lupinus albus subsp. albus taxon. After the isolated genomic DNAs were subjected to PCR reaction with SSR markers, PCR fragments were separated by 3% agarose gel electrophoresis. As a result of the studies, no polymorphism was found among the populations and these markers were the first SSR markers specific to this taxon. These markers can be used for assessment, mapping and marker assisted selection of genetic diversity Lupinus albus subsp. albus taxon.
It is targeted to develop a high number of genomic SSR markers specific for Lupinus albus L. subsp. albus (termiye) taxon grown in Turkey and to use these markers in genetic diversity studies. In this study, 48 plant samples collected from 6 different populations were used. The 71722, 11657, 1502, 21888 and 371 piece di-, tri-, tetra-, penta- and hekza-nükleotit SSR motifs were determined, respectively, in the thermite genome using the GMAT program. A total of 107140 primers were designed from these SSR motifs and 10 of these primers were used in PCR studies. DNA isolation from leaves was performed using the CTAB method from the collected samples of Lupinus albus subsp. albus taxon. After the isolated genomic DNAs were subjected to PCR reaction with SSR markers, PCR fragments were separated by 3% agarose gel electrophoresis. As a result of the studies, no polymorphism was found among the populations and these markers were the first SSR markers specific to this taxon. These markers can be used for assessment, mapping and marker assisted selection of genetic diversity Lupinus albus subsp. albus taxon.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Lupinus Albus Subsp. Albus, Moleküler Markör, SSR, Termiye, Molecular Marker
Kaynak
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
Sayı
Künye
Bayram, Y., (2023). Lupınus Albus L. Subsp. Albus Taksonunda Genomik Ssr Markörlerinin Geliştirilmesi. (Yüksek Lisans Tezi). Selçuk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Konya.
