An implementation for performing a computer based mutation analysis
Loading...
Date
2016
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Selçuk Üniversitesi Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu
Access Rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
Abstract
The history of Mutation Analysis can be sketched back from 1971 by Richard Lipton. It is vital to identify the variations occurred in DNA due to mutation. The aim of this work is to develop a new software that helps to predict the mutated sequence position found between the any two sequences whether it maybe DNA or Protein or it may be both. Moreover this approach is most effective and accurate to analyze sequences. The software is developed that helps to provide necessary input and get desired output. The output file will show the position were the mutation occur for protein 1 mutation occur in 1 for K and W and for C mutation occur in 40 position. Thus, the system runs to progress quality of testing and provide advance efficiency by means of various mutation operators. Computerized mutation analysis is performed without manual intervention.
Mutasyon analizi tarihi 1971 yılında Richard Lipton tarafından yapılan çalışmalara dayanmaktadır. Mutasyon nedeniyle DNA içerisindeki oluşan varyasyonların belirlenmesi kritik önem taşımaktadır. Bu çalışmanın özü; DNA, Protein veya her ikisi de olabilen herhangi iki sıra arasında bulunan mutasyon geçirmiş pozisyonların tahmin edilmesine yardımcı olacak yeni bir yazılım geliştirmektir. Üstelik sıra analizi için çok verimli ve doğru sonuç üreten bir yaklaşımdır. Bu yazılım, gerekli girişlerin kolayca sağlaması ve arzu edilen çıkışların alınmasına yardımcı olacak şekilde geliştirilmiştir. Çıktı dosyası, 40 pozisyon içindeki 1 pozisyondaki oluşan K,W ve C mutasyonunun yerini gösterecektir. Böylece bu sistemle, kaliteli bir test süreci gerçekleştirilmekte ve çeşitli mutasyon operatörleri vasıtasıyla verimlilikte ilerleme sağlanmaktadır. Bilgisayar tabanlı mutasyon analizi, manüel müdahale olmaksızın gerçekleştirilmiş olmaktadır.
Mutasyon analizi tarihi 1971 yılında Richard Lipton tarafından yapılan çalışmalara dayanmaktadır. Mutasyon nedeniyle DNA içerisindeki oluşan varyasyonların belirlenmesi kritik önem taşımaktadır. Bu çalışmanın özü; DNA, Protein veya her ikisi de olabilen herhangi iki sıra arasında bulunan mutasyon geçirmiş pozisyonların tahmin edilmesine yardımcı olacak yeni bir yazılım geliştirmektir. Üstelik sıra analizi için çok verimli ve doğru sonuç üreten bir yaklaşımdır. Bu yazılım, gerekli girişlerin kolayca sağlaması ve arzu edilen çıkışların alınmasına yardımcı olacak şekilde geliştirilmiştir. Çıktı dosyası, 40 pozisyon içindeki 1 pozisyondaki oluşan K,W ve C mutasyonunun yerini gösterecektir. Böylece bu sistemle, kaliteli bir test süreci gerçekleştirilmekte ve çeşitli mutasyon operatörleri vasıtasıyla verimlilikte ilerleme sağlanmaktadır. Bilgisayar tabanlı mutasyon analizi, manüel müdahale olmaksızın gerçekleştirilmiş olmaktadır.
Description
url: http://sutod.selcuk.edu.tr/sutod/article/view/298
Keywords
Mutation analysis, Computerized mutation analysis, DNA, Protein, Mutasyon analizi, Bilgisayarlı mutasyon analizi
Journal or Series
Selçuk-Teknik Dergisi
WoS Q Value
Scopus Q Value
Volume
15
Issue
Citation
Abubaker, B., Mohammed, H., Saraçoğlu, R. (2016). An implementation for performing a computer based mutation analysis. Selçuk-Teknik Dergisi, 15, (2), 71-84.
