Biodiversity of Penicillium species isolated from Edirne Söğütlük Forest soil (Turkey)

dc.contributor.authorKolanlarlı Korur, Tugba
dc.contributor.authorAsan, Ahmet
dc.contributor.authorŞen, Burhan
dc.contributor.authorÖkten, Suzan
dc.date.accessioned2019-12-13T20:59:08Z
dc.date.available2019-12-13T20:59:08Z
dc.date.issued2019
dc.description.abstractÇalışmamızda orman toprağından izole edilen Penicillium türlerinin, morfolojik, koloniyal ve moleküler yöntemlerle tespiti amaçlanmış ve Penicillium tür çeşitliliği incelenmiştir. Toprak örnekleri, Edirne Söğütlük Ormanı’ndan 2015 yılı Ekim ayında, 10 cm derinden aseptik şartlarda alınmış olup, Penicillium türlerinin izolasyonu için Waksman’ın ‘Toprağı Sulandırma Yöntemi’ kullanılmış; morfolojik ve koloniyal tanımlaması için çeşitli eserler kullanılmıştır. Moleküler tanı amacıyla izolasyon işlemi için Bio-Speedy™ fungal DNA izolasyonu kiti kullanılmıştır. PCR kiti olarak ise Bio-SpeedyTM Maya ve Küf RealTime PCR Hızlı Tespit Kiti kullanılmıştır. Elde edilen sekanslar gen bankası kullanılarak benzer sekanslarla BLAST analizi yapılmış ve Mega 7 yazılımı kullanılarak filogenetik ağaç çizilmiştir. Penicillium cinsine ait 12 tür tanımlanmıştır, bunlar: P. chrysogenum, P. citrinum, P. commune, P. manginii (geçerli isim: Penicillium atrosanguineum), P. ubiquetum (Türkiye için yeni kayıt), P. camemberti, P. sanguifluum, P. janczewskii, P. canescens, P. roseopurpureum, P. steckii (geçerli isim: Penicillium citrinum), P. hordei’ dir.en_US
dc.description.abstractWe studied Penicillium species isolated from forest soil and aimed to be detected with morphologically, colonial-molecular methods and species diversity. Soil sample was taken Edirne Söğütlük Forest in October, 2015 and 10 cm deep under aseptic conditions and Waksman’s ‘Soil Dilution Method’ was used for the isolation of Penicillium species; some books and articles have been used for morphological and colonial identification. The service was purchased for the molecular diagnosis of fungi and the company used the Bio-Speedy ™ Fungal DNA Isolation Kit for isolation. As PCR Kit, BioSpeedy™, yeast and mould real-time PCR rapid detection kit was used. The obtained sequences were subjected to BLAST analysis similar sequences using the gene bank and to draw phylogenetic tree, used Mega 7 software. Twelve species belonging to the genus Penicillium were identified; these are: P. chrysogenum, P. citrinum, P. commune, P. manginii (current name: Penicillium atrosanguineum), P. ubiquetum (New record for Turkey), P. camemberti, P. sanguifluum, P. janczewskii, P. canescens, P. roseopurpureum, P. steckii (current name: Penicillium citrinum), P. hordei.en_US
dc.identifier.citationKorur, T., Asan A., Şen B., Ökten S., (2019). Biodiversity of Penicillium Species İsolated from Edirne Söğütlük Forest Soil (Turkey). Selçuk Üniversitesi Mantar Dergisi, 10(1), 26-39. Doi:10.30708mantar.450370
dc.identifier.endpage39
dc.identifier.issn2147-6845en_US
dc.identifier.issue1
dc.identifier.startpage26
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12395/14959
dc.identifier.volume10
dc.language.isoenen_US
dc.publisherSelçuk Üniversitesi
dc.publisherSelçuk Üniversitesi Mantar Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakaleen_US]
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.selcuk20240510_oaigen_US
dc.subjectSoilen_US
dc.subjectTopraken_US
dc.subjectFungien_US
dc.subjectFungus,en_US
dc.subjectPenicilliumen_US
dc.subjectPenicilliumen_US
dc.subjectSanger Sequencing Methoden_US
dc.subjectSanger dizilemeen_US
dc.subjectITSen_US
dc.subjectEdirneen_US
dc.titleBiodiversity of Penicillium species isolated from Edirne Söğütlük Forest soil (Turkey)en_US
dc.title.alternativeEdirne İli (Türkiye) Söğütlük Ormanı Toprağından İzole Edilen Penicillium Türlerinin Biyoçeşitliliğien_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
701182.pdf
Boyut:
1.1 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale Dosyası