Moleküler mekanik ve yoğunluk fonksiyonelleri teorisi metodlarıyla siyanoasetik asit molekülünün molekül ve radikal yapılarının belirlenmesi
Yükleniyor...
Tarih
2016
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Selçuk Üniversitesi Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Siyanoasetik asit molekülünün potansiyel enerji yüzeyleri moleküler mekanik metotlarla taranmış ve elde edilen konformasyonların geometrileri B3LYP metodu ve 6- 311++G(d,p) baz setleriyle optimize edilmiştir. Molekülün beş farklı konformasyonu tespit edilmiştir. En kararlı konformasyonun yapısı, molekül yapısı olarak atanmıştır. Molekül yapısıyla ilgili daha önce yapılmış deneysel bir çalışma olmadığından molekülün geometri parametreleri detaylı bir şekilde ilk defa bu çalışmada verilmiştir. Literatürde yer alan teorik çalışmalarda elde edilmiş olan konformasyonlardan daha fazla konformasyon yapısı bu çalışmada tespit edilmiştir. En kararlı yapı kullanılarak ışınlama sonucunda oluşabilecek muhtemel radikaller modellenmiştir. Modellenen bu radikallerin konformasyon analizleri yapılıp en kararlı radikallerin Elektron Paramagnetik Rezonans parametreleri B3LYP metodu ve TZVP baz setleri kullanılarak hesaplanmıştır. Hesaplanan parametreler deneysel değerlerle karşılaştırılıp radikal yapısı belirlenmiştir. Tespit edilen radikalin detaylı geometri parametreleri ilk defa bu çalışmada verilmiştir.
Potential energy surfaces of cyanoacetic acid molecule was scanned by molecular mechanic methods and geometries of obtained conformers were optimized by B3LYP method and 6-311++G(d,p) basis sets. Five different conformers of the molecule were determined.The more structure of conformers than other theoretical studies performed before in the literature were determined. Using the most stable one, possible radicals which can be obtained from UV-irradiation were modeled. After the conformational analysis of these model radicals were performed, EPR parameters of the most stable ones were calculated by B3LYP method and TZVP basis sets. Comparing the calculated values with experimental counterparts, radical structure of the molecule was determined. Detailed geometry parameters of the obtained radical and molecule were given forthe first time in this study.
Potential energy surfaces of cyanoacetic acid molecule was scanned by molecular mechanic methods and geometries of obtained conformers were optimized by B3LYP method and 6-311++G(d,p) basis sets. Five different conformers of the molecule were determined.The more structure of conformers than other theoretical studies performed before in the literature were determined. Using the most stable one, possible radicals which can be obtained from UV-irradiation were modeled. After the conformational analysis of these model radicals were performed, EPR parameters of the most stable ones were calculated by B3LYP method and TZVP basis sets. Comparing the calculated values with experimental counterparts, radical structure of the molecule was determined. Detailed geometry parameters of the obtained radical and molecule were given forthe first time in this study.
Açıklama
url: http://sutod.selcuk.edu.tr/sutod/article/view/356
Anahtar Kelimeler
Siyanoasetik asit, Konformasyon analizi, Molekül yapısı, Radikal yapısı, Cyanoacetic acid, Conformational analysis, Molecular structure, Radical structure
Kaynak
Selçuk-Teknik Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
15
Sayı
Künye
Ateş, L., Erdoğdu, Y., Sarıkaya, E. K., Özturan, F. P., Dereli, Ö. (2016). Moleküler mekanik ve yoğunluk fonksiyonelleri teorisi metodlarıyla siyanoasetik asit molekülünün molekül ve radikal yapılarının belirlenmesi. Selçuk-Teknik Dergisi, 15, (3), 253-263.
