D-vitaminin meme kanseri hücrelerinde mikro rna üzerine etkisi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorÜnlü, Ali
dc.contributor.authorMercan, Aslı
dc.date.accessioned2017-10-11T12:56:47Z
dc.date.available2017-10-11T12:56:47Z
dc.date.issued2016
dc.departmentEnstitüler, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractVitamin D'nin aktif olan formu (1,25(OH)2D3) kalsiyum metabolizmasını düzenlemesinin yanısıra hücrenin proliferasyon, diferansiasyonunun düzenlenmesi gibi birçok fonksiyona da sahiptir. Bu fizyolojilerde oluşabilecek bozukluklar sonucunda aralarında kanser, osteoartrit, diabet gibi birçok hastalıkla da ilintili olduğu bilinmektedir. Bu çalışma, MCF7 insan meme kanseri hücresi miRNA'ları profilleri üzerine D-Vitamini uygulamasının etkilerini incelemektedir. Çalışmamızda, MCF-7 hücreleri D-vitaminin farklı saatlerde (2, 4, 6, 24 ve 48) ile tek dozda (140 uM) muamele edildi. Daha sonra total RNA, Roche yüksek saf miRNA İzolasyon Kiti (Roche Diagnostics) kullanarak izole edildi ve hücre lizatlarından cDNA sentezlendi. Gerçek zamanlı qPCR için 84 adet miRNA ekspresyonu, BioMarkTM 96,96 Dynamic Array (Fluidigm Corporation) ile saptanmıştır. İstatistiksel analiz Biogazelle en qase Plus 2,0 yazılımı kullanılarak yapıldı. Göreceli gen ekspresyonu değerlerinin tayini 2-ΔΔCt yöntemi (numunenin normalize edilmiş Ct (eşik döngüsü ) değeri- kontrolün normalize edilmiş Ct değeri) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. İstatistiksel analizler sonucunda, kontrol grubuna kıyasla 84 miRNA'nın 22 tanesi farklı şekilde (fold regulation <2, fold regulation>2, p<0.05) eksprese edilmiştir. Özelleştirilmiş veri tabanları kullanarak hesaplanan analizlere göre (DIANA miRPath v.2.0), PI3 kinaz/AKT (hsa04151), Wnt (hsa04310), MAPK (hsa04010) ve p53 (hsa 04115) sinyal yollakları (KEGG yolak numarası) bu miRNA grubunun temel hedefleri olduğu gibi görünmektedir. Bu bulgular, MCF-7 hücrelerinin miRNA profillerine TQ'nun etkilerini vurgulamaktadır ve daha ileri çalışmalara yardımcı olabilir.en_US
dc.description.abstractThe active form of vitamin D (1,25 (OH)2D3) as well as the regulation of calcium metabolism, cell proliferation, it also has many functions, such as regulation of differentiation. These physiological disorders may occur as a result of including cancer, osteoarthritis, diabetes as are known to be associated with many diseases. This study examines the effect of Vitamin D treatment on MCF7 human breast cancer cells miRNAs. profiles. In our study, MCF-7 cells at different times of vitamin D (2, 4, 6, 24 and 48) with a single dose (140 uM) were treated. Then total RNA was isolated by using Roche High Pure miRNA Isolation Kit (Roche Diagnostics) and cDNA was synthesized from cell lysates. The expressions of 84 miRNAs were determined by The BioMarkTM 96.96 Dynamic Array (Fluidigm Corporation) for real-time qPCR. Statistical analysis was performed using the Biogazelle's qbase PLUS 2.0 software. Determinations of relative gene expression values were carried out by using the 2-∆∆Ct method (normalized threshold cycle (Ct) value of sample minus normalized Ct value of control). As a result of the statistically analysis, twenty-two of 84 miRNAs have been differentially expressed compared to control group (fold regulation <2, fold regulation>2, p<0.05). According to computational analyses using specialized databases (as DIANA miRPath v.2.0); PI3 kinase/AKT (hsa04151), Wnt (hsa04310), MAPK (hsa04010) and p53 (hsa 04115) signaling pathways (KEGG pathway number) seem to be the key targets of these miRNA group. Thesefindings highlight the effects of TQ to miRNA profiling of MCF7 cells and may be helpful for further studies.en_US
dc.description.sponsorshipBu araştırma Selçuk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü tarafından 14202038 Proje numarası ile desteklenmiştir.en_US
dc.identifier.citationMercan, A. (2016). D-vitaminin meme kanseri hücrelerinde mikro rna üzerine etkisi. Selçuk Üniversitesi, Yayımlanmış yüksek lisans tezi, Konya.en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12395/6194
dc.language.isotren_US
dc.publisherSelçuk Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.selcuk20240510_oaigen_US
dc.subjectHücre dizisien_US
dc.subjectCell lineen_US
dc.subjectHücre kültür tekniklerien_US
dc.subjectCell culture techniquesen_US
dc.subjectMeme neoplazmlarıen_US
dc.subjectBreast neoplasmsen_US
dc.subjectMikro RNAen_US
dc.subjectMicro RNAen_US
dc.subjectNeoplazmlaren_US
dc.subjectNeoplasmsen_US
dc.subjectPolimeraz zincirleme reaksiyonuen_US
dc.subjectPolymerase chain reactionen_US
dc.subjectVitamin D eksikliğien_US
dc.subjectVitamin D deficiencyen_US
dc.titleD-vitaminin meme kanseri hücrelerinde mikro rna üzerine etkisien_US
dc.title.alternativeThe effect of vitamin D on micro-RNA levels in breast cancer cellsen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
440480_removed.pdf
Boyut:
1.41 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Aslı Mercan
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.51 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu