Koyunlardaki Sarcocystis Türlerinin Random Amplified Polymorphic Dna-Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RAPD-PCR) ile Teşhisi
Küçük Resim Yok
Tarih
2003
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/closedAccess
Özet
Bu çalışmada, koyun Sarcocystis türlerinin yaygınlıklarının belirlenmesi ve moleküler biyolojilerinin araştırılması amacıyla Random Amplified Polymorphic DNA Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve tripsin tekniği kullanılmıştır. Tür identifıkasyonu amacı ile S. gigantae için makroskobik ve mikroskobik kistlerden, S. arieticanis ve S. tenella için mikroskobik kistlerden yararlanılmıştır. DNA ekstraksiyonu için Fenol ekstraksiyon etanol prespitasyon metodu uygulanmıştır. Ayrıca, çalışmada Tripsin tekniği de uygulanarak, iki metodun sonuçları karşılaştırılmiştır. Koyunlardaki Sarcocystis türlerinin DNA'sını amplifiye etmek için farklı sekansa sahip üç primer (OSA-Ol, OSA-02 ve OSA-03) seçilmiştir. Random Amplified Polymorphic DNA Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RAPD-PCR) ile amplifiye edilen band sayıları ve katsayılar sayesinde genetik ilişkinin değerlendirilmesi ile patojen türlerin (S. tenella, ve S. arieticanis), ayrı bir küme oluşturan S. gigantea'dan açık bir şekilde ayrıldığı tesbit edilmiştir. Sonuç olarak; Sarcocystis türlerinin Konya yöresi koyunlarında çok yaygın ve S. tenella'nm dominant tür olduğu belirlenmiş, RAPD-PCR fingerprinting tekniğinin teşhis açısından tripsin tekniğinden daha duyarlı ve özgül olduğu saptanmıştır.
In this study, the RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA-PCR) and the trypsin technique were used to investigate the presence and prevalence of the ovine Sarcocystis spp.as well as their molecular biology. After optimization of the PCR conditions, three primers (OSA-Ol, OSA-02 and OSA-03) were selected to amplify DNA of the three parasite species. By generating band patterns with RAPD-PCR, it was possible to estimate the genetic relationship among the species in question. Among the pathogenic Sarcocystis spp., S. tenella and S. arieticanis that are grouped together are clearly distinct from S. gigantean, which forms a separate cluster. It was found that sarcocystosis is very common with the species S. tenella being dominant in sheep in the Konya Province. It was also found that the RAPD-PCR fingerprinting technique was more specific and sensitive than the trypsin technique.
In this study, the RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA-PCR) and the trypsin technique were used to investigate the presence and prevalence of the ovine Sarcocystis spp.as well as their molecular biology. After optimization of the PCR conditions, three primers (OSA-Ol, OSA-02 and OSA-03) were selected to amplify DNA of the three parasite species. By generating band patterns with RAPD-PCR, it was possible to estimate the genetic relationship among the species in question. Among the pathogenic Sarcocystis spp., S. tenella and S. arieticanis that are grouped together are clearly distinct from S. gigantean, which forms a separate cluster. It was found that sarcocystosis is very common with the species S. tenella being dominant in sheep in the Konya Province. It was also found that the RAPD-PCR fingerprinting technique was more specific and sensitive than the trypsin technique.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Genel ve Dahili Tıp, Parazitoloji
Kaynak
Türkiye Parazitoloji Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
27
Sayı
4
Künye
Aldemir, O. S., Dik, B. (2003). Koyunlardaki Sarcocystis Türlerinin Random Amplified Polymorphic DNA-Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RAPD-PCR) İle Teşhisi. Türkiye Parazitoloji Dergisi, 27(4), 255-259.
