Comparison of culture, Real- time-PCR, ELISA, and histopathological examination methods for identification of Helicobacter pylori
Küçük Resim Yok
Tarih
2018
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Introduction: There are several methods used for the diagnosis of Helicobacterpylori infections, and there is an increasing demand for theuse of non-invasive, more rapid tests. The aim of the present study wasto compare different diagnostic methods.Methods: A total of 87 patients who had undergone esophagogastroduodenoscopywere included in the study. Biopsy samples obtainedfrom these patients were used for culture, real-time polymerase chainreaction (RT-PCR), and histopathological examination. Stool sampleswere also collected from these patients and were tested using the Helicobacterpylori stool antigen (HpSA) kit. Histopathological examinationwas accepted as the gold standard test.Results: H. pylori was identified by histological examination in 77/87(87.5%) patients, whereas it was negative in 10/87 (12.5%) patients. Furthermore,positive results were obtained in 55 (63.2%), 71 (81.6%), and 77(87.5%) patients using the culture method, HpSA analysis, and RT-PCR method,respectively. The sensitivity and specificity of culture, HpSA, and PCRtests were determined as 71.4% and 100%, 87% and 60%, and 97.4% and80%, respectively. Antibiotic susceptibility tests were performed on 48 outof the 55 culture positive samples. Resistance to clarithromycin was foundin 28 (58.3%), metronidazole in 14 (29.2%), and levofloxacin in 4 (8.3%) ofthe isolates. Resistance to amoxicillin and tetracycline was not observed.Conclusion: There are currently several invasive and non-invasive diagnostictests for the detection of H. pylori infections. Each test has someadvantages and disadvantages. The diagnostic method of choice shouldbe easy and applicable to all age groups.
Amaç: Helicobacter pylori enfeksiyonlarının tanısında çeşitli yöntemlerkullanılmaktadır. Invazif olmayan, daha hızlı testlerin kullanımıiçin artan bir talep vardır. Bu çalışmanın amacı farklı tanı yöntemlerinikarşılaştırmaktır.Yöntemler: Çalışma özofagogastroduodenoskopi uygulanan 87 hastayıkapsamaktadır. Bu hastalardan alınan biyopsi örneklerindenkültür, Real-time PCR ve histopatolojik inceleme yapıldı. Ayrıca tümhastalardan dışkı örnekleri de alınıp H.pylori dışkı antijen testi (HpSA)uygulandı. Histopatolojik inceleme altın standart test olarak kabuledildi.Bulgular: Histopatolojik inceleme sonucu; 87 hastanın 77’si H. pyloripozitif (%87.5), 10’u ise (%12.5) negatif olarak belirlenmiştir. Kültür,HpSA ve Real-time PCR’nin duyarlılık ve özgüllükleri sırasıyla %71.4 ve%100, %87 ve %60, %97.4 ve % 80 olarak saptanmıştır. Kültür yöntemiylepozitif saptanan 55 örneğin 48’inde antibiyotik duyarlılık testleriçalışılmıştır. Klaritromisin direnci 28 (% 58.3), metronidazol direnci14 (% 29.2) ve levofloksasin direnci 4 (% 8.3) izolatta saptandı. Hiçbirizolatta amoksisilin ve tetrasiklin direnci saptanmadı.Sonuç: Günümüzde, Helicobacter pylori enfeksiyonlarının tanısındainvazif olan ve invazif olmayan çeşitli tanı testleri kullanılmaktadır.Her testin bazı avantajları ve dezavantajları vardır. Seçilen tanı yöntemi,tüm yaş gruplarına kolaylıkla uygulanabilir olmalıdır.
Amaç: Helicobacter pylori enfeksiyonlarının tanısında çeşitli yöntemlerkullanılmaktadır. Invazif olmayan, daha hızlı testlerin kullanımıiçin artan bir talep vardır. Bu çalışmanın amacı farklı tanı yöntemlerinikarşılaştırmaktır.Yöntemler: Çalışma özofagogastroduodenoskopi uygulanan 87 hastayıkapsamaktadır. Bu hastalardan alınan biyopsi örneklerindenkültür, Real-time PCR ve histopatolojik inceleme yapıldı. Ayrıca tümhastalardan dışkı örnekleri de alınıp H.pylori dışkı antijen testi (HpSA)uygulandı. Histopatolojik inceleme altın standart test olarak kabuledildi.Bulgular: Histopatolojik inceleme sonucu; 87 hastanın 77’si H. pyloripozitif (%87.5), 10’u ise (%12.5) negatif olarak belirlenmiştir. Kültür,HpSA ve Real-time PCR’nin duyarlılık ve özgüllükleri sırasıyla %71.4 ve%100, %87 ve %60, %97.4 ve % 80 olarak saptanmıştır. Kültür yöntemiylepozitif saptanan 55 örneğin 48’inde antibiyotik duyarlılık testleriçalışılmıştır. Klaritromisin direnci 28 (% 58.3), metronidazol direnci14 (% 29.2) ve levofloksasin direnci 4 (% 8.3) izolatta saptandı. Hiçbirizolatta amoksisilin ve tetrasiklin direnci saptanmadı.Sonuç: Günümüzde, Helicobacter pylori enfeksiyonlarının tanısındainvazif olan ve invazif olmayan çeşitli tanı testleri kullanılmaktadır.Her testin bazı avantajları ve dezavantajları vardır. Seçilen tanı yöntemi,tüm yaş gruplarına kolaylıkla uygulanabilir olmalıdır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Genel ve Dahili Tıp, Tıbbi Araştırmalar Deneysel
Kaynak
İstanbul Medical Journal
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
19
Sayı
2
