Biodiversity of Penicillium species isolated from Edirne Söğütlük Forest soil (Turkey)

Kolanlarlı. Tuğba Korur; Asan, Ahmet; Sen, Burhan; Ökten, Suzan

Biodiversity of Penicillium species isolated from Edirne Söğütlük Forest soil (Turkey)

dc.authorid	0000-0001-6561-7384	en_US
dc.authorid	0000-0002-4132-3848	en_US
dc.authorid	0000-0002-8477-9570	en_US
dc.authorid	0000-0003-3372-5617	en_US
dc.contributor.author	Kolanlarlı. Tuğba Korur
dc.contributor.author	Asan, Ahmet
dc.contributor.author	Sen, Burhan
dc.contributor.author	Ökten, Suzan
dc.date.accessioned	2020-09-07T10:27:18Z
dc.date.available	2020-09-07T10:27:18Z
dc.date.issued	2019	en_US
dc.department	Selçuk Üniversitesi	en_US
dc.description.abstract	We studied Penicillium species isolated from forest soil and aimed to be detected with morphologically, colonial-molecular methods and species diversity. Soil sample was taken Edirne Söğütlük Forest in October, 2015 and 10 cm deep under aseptic conditions and Waksman’s ‘Soil Dilution Method’ was used for the isolation of Penicillium species; some books and articles have been used for morphological and colonial identification. The service was purchased for the molecular diagnosis of fungi and the company used the Bio-Speedy ™ Fungal DNA Isolation Kit for isolation. As PCR Kit, BioSpeedy™, yeast and mould real-time PCR rapid detection kit was used. The obtained sequences were subjected to BLAST analysis similar sequences using the gene bank and to draw phylogenetic tree, used Mega 7 software. Twelve species belonging to the genus Penicillium were identified; these are: P. chrysogenum, P. citrinum, P. commune, P. manginii (current name: Penicillium atrosanguineum), P. ubiquetum (New record for Turkey), P. camemberti, P. sanguifluum, P. janczewskii, P. canescens, P. roseopurpureum, P. steckii (current name: Penicillium citrinum), P. hordei.	en_US
dc.description.abstract	Çalışmamızda orman toprağından izole edilen Penicillium türlerinin, morfolojik, koloniyal ve moleküler yöntemlerle tespiti amaçlanmış ve Penicillium tür çeşitliliği incelenmiştir. Toprak örnekleri, Edirne Söğütlük Ormanı’ndan 2015 yılı Ekim ayında, 10 cm derinden aseptik şartlarda alınmış olup, Penicillium türlerinin izolasyonu için Waksman’ın ‘Toprağı Sulandırma Yöntemi’ kullanılmış; morfolojik ve koloniyal tanımlaması için çeşitli eserler kullanılmıştır. Moleküler tanı amacıyla izolasyon işlemi için Bio-Speedy™ fungal DNA izolasyonu kiti kullanılmıştır. PCR kiti olarak ise Bio-SpeedyTM Maya ve Küf RealTime PCR Hızlı Tespit Kiti kullanılmıştır. Elde edilen sekanslar gen bankası kullanılarak benzer sekanslarla BLAST analizi yapılmış ve Mega 7 yazılımı kullanılarak filogenetik ağaç çizilmiştir. Penicillium cinsine ait 12 tür tanımlanmıştır, bunlar: P. chrysogenum, P. citrinum, P. commune, P. manginii (geçerli isim: Penicillium atrosanguineum), P. ubiquetum (Türkiye için yeni kayıt), P. camemberti, P. sanguifluum, P. janczewskii, P. canescens, P. roseopurpureum, P. steckii (geçerli isim: Penicillium citrinum), P. hordei’ dir	en_US
dc.identifier.doi	10.30708mantar.450370	en_US
dc.identifier.endpage	39	en_US
dc.identifier.issn	2147-6845	en_US
dc.identifier.issue	1	en_US
dc.identifier.startpage	26	en_US
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12395/40267
dc.identifier.volume	10	en_US
dc.language.iso	en	en_US
dc.publisher	Selçuk Üniversitesi, Mantarcılık Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü	en_US
dc.relation.ispartof	Mantar Dergisi	en_US
dc.relation.publicationcategory	Makale - Ulusal - Editör Denetimli Dergi - Başka Kurum Yazarı	en_US
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	en_US
dc.selcuk	20240510_oaig	en_US
dc.subject	Toprak	en_US
dc.subject	Fungus	en_US
dc.subject	Soil	en_US
dc.subject	Fungi	en_US
dc.title	Biodiversity of Penicillium species isolated from Edirne Söğütlük Forest soil (Turkey)	en_US
dc.title.alternative	Edirne İli (Türkiye) Söğütlük Ormanı toprağından izole edilen Penicillium türlerinin biyoçeşitliliği	en_US
dc.type	Article	en_US