Determination of 1h and 13c nuclear magnetic resonance chemical shift values of glyoxime molecule with experimental and theoretical methods
Yükleniyor...
Tarih
2019
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
In this study, the conformational analysis was performed by the semi-empiricalPM3 method to determine the molecular structure of the glyoxime molecule. Each ofconformer was optimized using the Density Functionals Theory (DFT) with DFT /B3LYP / 6-311G (d, p) method basis set combination. As a result of theoptimization, the most stable structure was determined according to the energy order.The chemical shift values of 1H and 13C, which were Nuclear Magnetic Resonance(NMR) parameters of this stable structure, were calculated in liquid phase and gas phaseusing DFT method and six different basis sets. Furthermore, the effect of intermolecularhydrogen bonding on 1H chemical shift values was investigated by dimer molecularmodeling at the level of B3LYP / 6-31G (d, p) in the DFT method. Also, the 1H and13C chemical shift values of the glyoxime molecule were determined experimentally.Structural analyzes of the glyoxime molecule were made by comparing the calculatedNMR parameters with the experimental NMR parameters.
Bu çalışmada glioksim molekülünün moleküler yapısını belirlemek içinkonformasyon analizi yarı deneysel PM3 metodu ile yapılmıştır. Elde edilenkonformasyonlar Yoğunluk Fonksiyonelleri Metodu (DFT) kullanılarak DFT/B3LYP/6-311G(d,p) metot baz seti kombinasyonu ile optimize edilmiştir. Optimizasyonsonucunda enerji durumuna göre en kararlı yapı bulunmuştur. Bu kararlı yapıya aitNükleer Manyetik Rezonans (NMR) parametreleri olan 1H ve 13C kimyasal kaymadeğerleri, DFT metodu ve 6 farklı baz seti kullanılarak sıvı fazda ve gaz fazındahesaplanmıştır. Ayrıca moleküller arası hidrojen bağının, 1H kimyasal kaymadeğerlerine etkisi DFT metodunda B3LYP/ 6-31G(d,p) seviyesinde dimer molekülermodellemesi yapılarak incelenmiştir. Aynı zamanda glioksim molekülünün 1H ve 13Ckimyasal kayma değerleri deneysel olarak da tespit edilmiştir. Hesaplanan NMRparametreleri ile deneysel NMR parametreleri karşılaştırılarak glioksim molekülününyapı analizleri yapılmıştır.
Bu çalışmada glioksim molekülünün moleküler yapısını belirlemek içinkonformasyon analizi yarı deneysel PM3 metodu ile yapılmıştır. Elde edilenkonformasyonlar Yoğunluk Fonksiyonelleri Metodu (DFT) kullanılarak DFT/B3LYP/6-311G(d,p) metot baz seti kombinasyonu ile optimize edilmiştir. Optimizasyonsonucunda enerji durumuna göre en kararlı yapı bulunmuştur. Bu kararlı yapıya aitNükleer Manyetik Rezonans (NMR) parametreleri olan 1H ve 13C kimyasal kaymadeğerleri, DFT metodu ve 6 farklı baz seti kullanılarak sıvı fazda ve gaz fazındahesaplanmıştır. Ayrıca moleküller arası hidrojen bağının, 1H kimyasal kaymadeğerlerine etkisi DFT metodunda B3LYP/ 6-31G(d,p) seviyesinde dimer molekülermodellemesi yapılarak incelenmiştir. Aynı zamanda glioksim molekülünün 1H ve 13Ckimyasal kayma değerleri deneysel olarak da tespit edilmiştir. Hesaplanan NMRparametreleri ile deneysel NMR parametreleri karşılaştırılarak glioksim molekülününyapı analizleri yapılmıştır.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Glyoxime, Nuclear magnetic resonance, Density functional theory, Hydrogen bonding, Biyoloji Çeşitliliğinin Korunması, Çevre Bilimleri, Glioksim, Nükleer manyetik rezonans, Yoğunluk fonksiyonelleri teorisi, Hidrojen bağı
Kaynak
Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
9
Sayı
1
Künye
Taşdemir, H. U., Sevgi, F., Türkkan, E. (2019). Determination of 1H and 13C Nuclear Magnetic Resonance Chemical Shift Values of Glyoxime Molecule with Experimental and Theoretical Methods. Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, 9(1), 99-112.
