Differences of viral panel positive versus negative by real-time PCR in COPD exacerbated patients

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0001-6563-8337
dc.authorid0000-0002-0342-0364
dc.authorid0000-0002-1000-7818
dc.contributor.authorYormaz, Burcu.
dc.contributor.authorFındık, Duygu.
dc.contributor.authorSüerdem, Mecit.
dc.date.accessioned2020-03-26T20:13:25Z
dc.date.available2020-03-26T20:13:25Z
dc.date.issued2019
dc.departmentSelçuk Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Dahili Tıp Bilimleri Bölümüen_US
dc.description.abstractIntroduction: Exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are often caused by respiratory tract infections. The aim of this study was to investigate the clinical, laboratory and computed tomography features of patients with hospitalized COPD exacerbations in which respiratory viruses were detected using a real-time polymerase chain reaction (PCR) technique. Materials and Methods: This retrospectively planned study included patients hospitalized in the chest diseases clinic due to exacerbation of COPD between November 2018-February 2019. The study included patients who had virus-specific real-time PCR, and computed tomography scans of the chest. Results: A total of 110 patients were included in the study. Respiratory viruses were identified in the nasopharyngeal swabs of 50 patients (45.5%) using the real-time PCR method, with rhinovirus (25%), influenza A (13.1%) and coronavirus (11.8%) being the most commonly isolated agents. The mean age of the patients was 68.28 +/- 9.59 years in the virus-positive group and 68.20 +/- 8.27 years in the virus-negative group (p= 0.963). Gender distribution, rate of smokers, exposure to biofuels, blood leukocyte count, neutrophil percentage, C-reactive protein (CRP) level, FEV1/FVC ratio did not significantly differ between the two groups (p> 0.05). Procalcitonin (PCT) and TEV1 values were significantly lower (p= 0.001 and p= 0.028, respectively) and the number of exacerbations was significantly higher in the virus-positive group (p= 0.001). The length of hospital stay was longer in the virus-positive group than in the virus-negative group (p= 0.012). Among the findings of computed tomography (CT) of the chest, bronchial wall thickening, cystic bronchiectasis, and emphysema did not differ significantly (p> 0.05). The rate of infiltrative lesions (tree-in-bud opacity, ground-glass opacity, atypical pneumonia) was significantly higher in the virus-positive group (p= 0.020). Conclusion: Viral respiratory tract infections should be considered in hospitalized patients with an exacerbation of COPD who have a history of frequent exacerbations, normal PCT value, and the absence of consolidation in CT scan of the chest. The use of broad-spectrum antibiotic therapy should be avoided in patients with these features.en_US
dc.description.abstractGiriş: Kronik obstrüktif akciğer hastalığı (KOAH)'nın alevlenmesi genellikle solunum yolu infeksiyonlarından kaynaklanır. Bu çalışmanın amacı, gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tekniği kullanılarak solunum yolu virüslerinin tespit edildiği hastane yatışı olan KOAH alevlenmeli hastaların klinik, laboratuvar ve bilgisayarlı tomografi özelliklerini araştırmaktı. Materyal ve Metod: Retrospektif olarak planlanan bu çalışmaya, Kasım 2018-Şubat 2019 tarihleri arasında KOAH alevlenmesi nedeniyle göğüs hastalıkları kliniğinde yatan hastalar alındı. Çalışma, virüse özgü gerçek zamanlı PCR tekniği ile viral panel bakılmış ve akciğer tomografisi olan hastaları içermektedir. Bulgular: Toplam 110 hasta çalışmaya dahil edildi. Elli hastanın (%45.5) nazofarengeal sürüntülerinde solunum virüsleri, gerçek zamanlı PCR yöntemi kullanılarak tanımlandı, rinovirüs (%25), influenza A (%13.1) ve coronavirüs (%11.8) en sık izole edilen ajanlardı. Hastaların yaş ortalaması virüs pozitif grupta 68.28 ± 9.59 ve virüs negatif grupta 68.20 ± 8.27 (p= 0.963) idi. Cinsiyet dağılımı, sigara içenlerin oranı, biyoyakıt maruziyeti, kan lökosit sayısı, nötrofil yüzdesi, C-reaktif protein (CRP) düzeyi, FEV1/FVC oranı bakımından iki grup arasında anlamlı fark görülmedi (p> 0.05). Virüs pozitif grupta, Prokalsitonin (PCT) ve FEV1 değerleri anlamlı derecede düşüktü (sırasıyla p= 0.001 ve p= 0.028) ve alevlenme sayısı anlamlı olarak daha yüksekti (p= 0.001). Hastanede kalış süresi virüs pozitif grupta virüs negatif gruptan daha uzundu (p= 0.012). Bilgisayarlı tomografi (BT), bronş duvarı kalınlaşması, kistik bronşektazi ve amfizem bulguları arasında anlamlı fark bulunmadı (p> 0.05). Virüs pozitif grupta infiltratif lezyonların oranı (tomurcuklanmış ağaç opasitesi, buzlu cam opasitesi, atipik pnömoni) anlamlı olarak yüksekti (p= 0.020). Sonuç: Sık alevlenme öyküsü mevcut, normal PCT değeri olan ve göğüs tomografisinde konsolidasyon bulunmayan KOAH alevlenme nedeniyle hastane yatışı olan hastalarda viral solunum yolu infeksiyonları düşünülmelidir. Bu özelliklere sahip hastalarda geniş spektrumlu antibiyotik tedavisi kullanmaktan kaçınılmalıdır
dc.identifier.citationYormaz, B., Fındık, D., Süerdem, M. (2019). Differences of Viral Panel Positive Versus Negative by Real-Time PCR in COPD Exacerbated Patients. Tuberculosis and Thorax, 67(2), 124-130.
dc.identifier.doi10.5578/tt.68471en_US
dc.identifier.endpage130en_US
dc.identifier.issn0494-1373en_US
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.pmid31414643en_US
dc.identifier.scopusqualityQ3en_US
dc.identifier.startpage124en_US
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.5578/tt.68471
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12395/37691
dc.identifier.volume67en_US
dc.identifier.wosWOS:000475751900006en_US
dc.identifier.wosqualityN/Aen_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.indekslendigikaynakPubMeden_US
dc.institutionauthorYormaz, Burcu.
dc.institutionauthorFındık, Duygu.
dc.institutionauthorSüerdem, Mecit.
dc.language.isoenen_US
dc.publisherTURKISH ASSOC TUBERCULOSIS & THORAXen_US
dc.relation.ispartofTUBERKULOZ VE TORAK-TUBERCULOSIS AND THORAXen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.selcuk20240510_oaigen_US
dc.subjectChronic obstructive pulmonary diseaseen_US
dc.subjectprocalcitoninen_US
dc.subjectviral respiratory panelen_US
dc.subjectKronik obstrüktif akciğer hastalığı
dc.subjectprokalsitonin
dc.subjectviral respiratuvar panel
dc.titleDifferences of viral panel positive versus negative by real-time PCR in COPD exacerbated patientsen_US
dc.title.alternativeKOAH alevlenmeli hastalarda gerçek zamanlı PCR tekniğiyle viral panel pozitif olanların negatif olanlardan farklılığıen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Burcu YORMAZ.pdf
Boyut:
109.49 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Full Text Access
İndir

Koleksiyon

WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Göğüs Hastalıkları/Makale Koleksiyonu
PubMed İndeksli Yayın Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Tıbbi Mikrobiyoloji/Makale Koleksiyonu